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建筑面积很大，自助取票也比较多，为杭州上海线的旅客设立了单独的VIP候车室。二楼是餐厅。

舟山普陀长途客运中心中心主楼分地上4层，主要到朱家尖蜈蚣峙码头、半升洞码头、墩头码头及沈家门城区和东港、芦花、展茅等地区。